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O curso de Medicina Veterinária da Fatenp organizou junto com a instituição um ponto de coleta para a campanha “Ecopet”. A Ecopet recolhe os plásticos doados (tampas, tampinhas) e o vende para reciclagem. Com o dinheiro são feitas castrações de animais abandonados e em situação de risco na grande Florianópolis.
A IES também é ponto de descarte de medicamentos vencidos e em desuso, repassando os materiais aos órgãos responsáveis.